Система идентификации микроорганизмов (MICROSEQ MICROBIAL IDENTIFICATION SYSTEM)
разработана компанией Applied Biosystems (США).
С помощью системы MicroSeq возможно определять более тысячи видов микроорганизмов (бактерии, дрожжи и грибы). Процесс идентификации занимает всего 8 часов, начиная с выделения ДНК и до обработки результата при помощи специального программного обеспечения. При использовании системы MicroSeq, вам не понадобится предварительная информация о микроорганизме, не нужна окраска по Грамму, не нужны предварительные биохимические исследования, не нужен опыт работы.
По сравнению с другими методами определения микроорганизмов, MicroSeq на сегодняшний день единственная коммерческая система, которая на специальных испытаниях показала 100% точность и 100% воспроизводимость результатов при определении 18 линий из коллекции American Type Culture Collection (ATCC) микроорганизмов, которые наиболее часто встречаются в местах производства фармацевтической продукции.
База данных MicroSeq включает более 1700 видов, как грамм отрицательных, так и грамм положительных бактерий. С 2003 года в базу данных добавлена информация об особо опасных патогенах - Bacillus anthracis, Francisella tularensis, Yersinia pestis, Brucella melitensis. Библиотека для грибов содержит информацию о более чем 1000 видов. Обе библиотеки непрерывно обновляются и пополняются новыми видами. Библиотеки содержат информацию о полиморфизмах и включают бактериальные агенты категории А. Также, вы можете создавать собственные библиотеки для интересующих вас видов и добавлять информацию о генетических последовательностях новых или известных видов.
Система MicroSeq определяет бактерии с помощью автоматического сиквенирования универсального гена 16S рибосомальной РНК (rRNA) - основной показатель бактериальной таксономической классификации в Bergey's Manual. Грибы идентифицируются с помощью сиквенирования D2 участка гена 26S rRNA. После сиквенирования гена rRNA система автоматически сравнивает результаты с данными микробных библиотек MicroSeq и выдает список соответствующих результатов. Данные результаты распределяются в соответствии с генетической дистанцией от образца и отображаются на мониторе в виде филогенетического дерева. Программное обеспечение автоматически определяет процент сходства неизвестного образца с наиболее схожими образцами из библиотеки MicroSeq, основанной на подобии информации о нуклеотидной последовательности и филогенетического дерева.
Наборы, реагенты и программное обеспечение:
PrepMan® Ultra Reagent – специально разработанный реактив для выделения ДНК из колоний или культур микроорганизмов;
MicroSeq 500 16S Bacterial Identification Kit - набор, который состоит из реагентов для идентификации бактерий, основанный на сиквенировании 500 пн 16S РНК гена;
MicroSeq Full Gene 16S Bacterial Identification Kit - включает реактивы для определения бактерий по полной последовательности 16S РНК гена;
MicroSeq D2LSU Fungal Identification Kit - набор для идентификации грибов по ядерной рибосомальной ДНК;
MicroSeq ID Analysis Software - программное обеспечение, которое включает все необходимое для идентификации микроорганизмов.
Система MicroSeq объединяет в себе инструментальную поддержку, наборы реактивов, библиотеки последовательностей ДНК и программное обеспечение, необходимые для автоматизированного сиквенирования ДНК микроорганизмов. Каждый компонент системы подобран для качественной и точной совместимой работы, что делает вашу работу удобной и позволяет получать достоверные, точные и воспроизводимые результаты.
Данная система может использоваться:
В лабораториях по контролю продуктов питания и напитков – мониторинг, контроль процесса приготовления, выявление при вспышках заболеваний;
В сельском хозяйстве - идентификация патогенных грибов в c/х продукции и при ее хранении;
В медицине - идентификация микроорганизмов;
На фармацевтическом производстве - контроль качества субстанций и готовой продукции;
В сфере экологии - оценка биологического разнообразия в естественных условиях;
В коллекциях культур микроорганизмов – подтверждение.
|